Für Gewässerschutzmaßnahmen sind bereits vor Einführung der WRRL erhebliche Investitionen getätigt worden. Ergänzende Maßnahmen für Erreichen der Umweltziele nach WRRL durch die Umsetzung von wird weiterhin mit hohen Kosten verbunden sein, wobei die Schwerpunkte für das Erreichen der Umweltziele nach WRRL neu auszurichten sind.

Für die Finanzierung wasserwirtschaftlicher Maßnahmen werden allgemeine und zweckgebundene Landesmittel aus den Wassernutzungsabgaben zur Kofinanzierung von Fördermitteln des Bundes aus der Gemeinschaftsaufgabe Agrarstruktur und Küstenschutz sowie der Fördermittel der Europäischen Gemeinschaft (ELER) verwendet.